一株Ⅱ型甲烷氧化菌中甲烷单加氧酶基因和16S rDNA的分析 | |
Department | 羰基合成与选择氧化国家重点实验室 |
华绍烽; 李树本 | |
2009 | |
Source Publication | 微生物学报 |
ISSN | 0001-6209 |
Volume | 49Issue:3Pages:294-301 |
Abstract | 【目的】利用分子生物学方法对一株甲烷氧化菌Methylosinus trichosporium IMV3011中的16S rDNA和溶解性甲烷单加氧酶基因序列进行分析并探索其进化分类地位。【方法】利用基因数据库已有的基因序列信息,设计PCR扩增引物和基因测序引物,对溶解性甲烷单加氧酶基因和16S rDNA进行扩增和测序,并进行溶解性甲烷单加氧酶的6个基因和氨基酸序列与同类菌株的相应序列进行联配分析。【结果】获得了全长为5319bp甲烷单加氧酶基因序列和长度为1290bp的16S rDNA序列。该菌株与Methylosinus trichosporium OB3b中相对应基因的同一性是99.0%~82.7%,MMOX氨基酸序列的同一性为99.4%~81.8%,相似性为99.8%~89.2%。基于以上分析表明MMOX组分有很高的序列保守性,特别是在活性中心区域。【结论】菌株IMV3011属于甲基弯菌属,最近似的菌株是Methylosinus trichosporium OB3b。 |
Keyword | 甲烷氧化菌 甲烷单加氧酶 基因测序 16s Rdna 进化分析 Methanotroph Soluble Methane Monooxygenases Gene Sequence Phylogenetic Analysis |
Subject Area | 物理化学 |
Funding Organization | 国家自然科学基金(20573124;20873167) |
Indexed By | CSCD |
Language | 中文 |
Funding Project | 清洁催化与生物转化研究组 ; 环境催化与清洁能源研究组 |
Citation statistics |
Cited Times:1[CSCD]
[CSCD Record]
|
Document Type | 期刊论文 |
Identifier | http://ir.licp.cn/handle/362003/639 |
Collection | 羰基合成与选择氧化国家重点实验室(OSSO) |
Recommended Citation GB/T 7714 | 华绍烽,李树本. 一株Ⅱ型甲烷氧化菌中甲烷单加氧酶基因和16S rDNA的分析[J]. 微生物学报,2009,49(3):294-301. |
APA | 华绍烽,&李树本.(2009).一株Ⅱ型甲烷氧化菌中甲烷单加氧酶基因和16S rDNA的分析.微生物学报,49(3),294-301. |
MLA | 华绍烽,et al."一株Ⅱ型甲烷氧化菌中甲烷单加氧酶基因和16S rDNA的分析".微生物学报 49.3(2009):294-301. |
Files in This Item: | ||||||
File Name/Size | DocType | Version | Access | License | ||
B85_一株_型甲烷氧化菌中甲烷单加氧酶(3491KB) | 开放获取 | License | View Application Full Text |
Items in the repository are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.
Edit Comment